霖然 試造
藥師法門，實是釋迦世尊特勝言教，琉璃淨光，確為三一實相真味表徵。遙念世尊八千往返，塵點劫中悲心降世，現種種身，作種種行，而於無窮暗夜，點無盡之明燈，三身難思，三德超勝。台宗後學慧薄福淺，不諳教觀，欲仿古德五重玄義，略判攝之，多有謬誤，望諸善士不吝斧正。
初、釋名：藥師法門一切功德，皆由本願之所流露。此中意趣，非為匯歸果德尊名之所能表，若論本願，誰不知者？若論功德，或約經之一字者，亦多註疏，此不贅述。但從佛名釋之。
然論名字，則有多解。佛法雖是一相一味，非言思相，然根器不同，施設不同，此中意趣，一雨普潤，草木俱生。法門利益亦復如是，下者得下，中者等中，上者得上，無等者得無等。約通義釋，如太虛，印順，南公，吳老諸所釋者，均通於此。藥者，法藥，師者，九法界之師，琉璃光者，約如如智光。另，藥師表悲，琉璃光表智，福慧不二之菩薩道，即由此顯發。
若論深處，藥，師，琉璃光，亦是同一實相，究竟不二。否則經中所說，唯除等覺，方能明了，豈非謬語？奘本中說：此是如來甚深行處。即在此地。
如來妙方便，均以藥者表徵，經論常言「唯佛一人持淨戒，餘人皆名破戒者」，或言九法界皆病，唯除佛法界，此即以平日所用，四大不調生理病症，代為無明也。而如來興教，被下施言，四種悉檀，無量方便，乃至解脫道，菩提道，密乘道，皆是勝藥。藥師法門，以佛莊嚴而自莊嚴，識病知藥，自服亦教人服，若明此意，當下即是自利利他之菩薩道，更無宗派門戶之見，何故？諸佛教法，一相一味，同運彼岸，不敢輕慢。當今聖教法見相左，斗諍堅固，若能體察此藥師法門之深意，或可拯此於頹勢也。
三身三德尊貴者，亦以師者表之，再論深者，則我等師，如何不是本來覺藏，當下具足，若不外求，即知萬法唯心，無量法藏，一時湧出。何況一色一香，皆是中道，處處是師，處處化佛，華嚴玄門，法華實相，由此而入。
五方佛之不動如來，或如普賢王如來，此不動湛然之法性，即以琉璃光色表徵。如朗朗晴空，淨明通透，如來究竟覺海，即是琉璃光色浩空，風雷雲雨等，猶五住地，此處究竟不可得，而復如幻顯現，與妙圓心者，非即非離。涅槃生死，煩惱覺悟，此等分別戲論，均於琉璃光中，泯絕不現。
若以三諦及三惑配，則師是真諦，斷見思，藥是假諦，斷塵沙，琉璃光是中諦，斷無明。若假湛然大師始終心要言之：明師之真意，則空觀易成，圓斷見思，顯空寂，成般若；明藥之真意，假觀易成，圓斷塵沙，通化導，成解脫；明琉璃光之真意，中觀成就，圓斷無明，法性彰，成法身也。
辨體第二：復明一部之旨歸，眾義之中樞。本經題是本願功德，若言體者，准此可知。當下即是第一佛乘，權實不二。時時勸修，處處令發。
十二大願，「乃至證得無上菩提」，處處明志。第一願者，願無量眾生，得佛身無量莊嚴，安住無量剎土光明，實大千世界，盡化佛國。第二願者，願無量眾生，承辦諸等事業，真事業者，實佛種種化身無量慈濟之事業。第三願者，願無量眾生，得無量受用，真受用者，實報身莊嚴。第四願者，願無量眾生，舍偏邪歸中正，究竟踏履菩提道，法身之妙智也。
上來四願，先明佛土及三身莊嚴。
復約第五願，淨戒得持，行願品中「無垢無破無穿漏」是也。第六願者，諸根具足，身形完好，無有病苦。上來兩者，若約深意，實即佛地之功德，前文已述。
第七願者，身心安樂，眷屬資具具足，此則安住法界虛空，方名無量安樂，眷屬者，理性眷屬，業生眷屬，願生眷屬，神通生眷屬，應生眷屬，皆佛眷屬。
第八願者，轉女成丈夫，問：何故此處，特不以四字，言轉女成男？答：准大般涅槃經中說，女人者，河沙欲樂難滿其欲，然誰是女人？不了身中如來藏，不明當發菩提心者是。非謂具女子根身也。一切惡穢煩惱，頓轉十八不共。如法華經中，龍女即身成佛，即此意也。此藥師經者，能通最上乘者，此處可知。
第九願者，已然明顯。第十願者，煩惱盜賊，無明惡王。第十一願者，無上究竟法味。第十二願者，無量受用。
後合論。然則藥師世尊，既成正覺，我等有情，何不頓具經中所說，依正二報？當知如始終心要言：「真如界內，絕生佛之假名，平等慧中，無自他之形象。但以眾生妄想，不自證得，莫之能返也。」
真言宗光明流悟光上師言：「釋迦佛介紹的譬如說藥師佛是東方琉璃世界，為什麼有這個藥師佛的出現？釋迦佛是讓你的心信仰佛教，你來，把教義給你解釋，向你介紹這種經典、這種作為，那麼藥師佛便進入你心的內體，你自己就變成藥師佛啦！你自己是佛，保庇自己是佛，佛保庇佛！若你是凡夫的心，那麼你就要成為凡夫保庇凡夫。所以唸經、唸咒，有這種信仰——自己是佛，當你唸經唸到一心不亂，很專心，這時你就變成藥師佛！」
藥師經法，既證此境之秘鑰，十二大願皆已成就，切莫再論，何故藥師成佛，我等行人尚有疾病，等觀自心，解悟深意。如開元三大士之不空大師所譯之《成就妙法蓮華經王瑜伽觀智儀軌》言：則悟身中如來藏，無價寶珠今覺知。復次，天台教下，常言：如來之藏，隨緣不變，不變隨緣。隨拈一法，無非法界，心佛眾生，三無差別。復曰：一色一香，無非中道，理具事造，兩重三千，同在一念。
此義甚深難解，不假開示，無由得入。若論訣竅，則當勤觀中道，若尚以為佛與眾生，如天壤雲泥，不解當下即是唯心所造，自然難信難解。
若上所言難解，可依義淨法師之七佛譯本，此中言，若欲成就此種種功德因緣，當勤修藥師經法，當勤念藥師佛名云云。無論解了或是修持，最簡最易。不具別圓菩薩根器者，從此處觀，即可悟入。
三、明宗：藥師經法所實修者，方便有多，究竟匯一，如教下言：圓人用法，無法不圓。諸法門者，亦復如是。縱是如來甚深法，闡提手中難受用。諸成就深淺，均論行人福慧資糧，而均各自輾轉，獲其益也。於末後判教則有言之。此經之所宗者，即是普遍法雨，各得受益，末後匯歸佛道也。
此分釋諸行門，末後匯歸此宗。由是既彰宗趣，亦顯諸行。
一念佛方便。一持名門，此合當世淨宗之持名，乃假佛號，攝於亂心，漸次令心純一，運至伏見思之境，或有更勝。二憶念門，如昏沉暗蔽，觀藥師佛化身相好隨行；如惡念思維，以藥師大日（此處係指報身，即通常所言盧舍那）不二，無量功德莊嚴，悉皆圓滿；如境界逼迫，當思法身之理，或以十二誓願，三主要道為所觀境。此憶念門，即五停心之念佛觀。
二持咒方便。真言教者，三密相應，直趣佛地，而藥師經法，非系密宗之特弘法門，藥師佛者，尚不見於金胎二界，亦乏於弘傳，雖有儀軌普傳，及印明等，未必便如其餘本尊法，為人所重。然諸佛同體，但得至心，無不感應。藥師灌頂咒法，能依師則佳，若苦無阿闍梨，則誦大輪金剛陀羅尼等，亦可跏趺而坐，結印持咒，觀想種字。
三誦經禮懺方便。蓋按儀軌，如弘一律師所集要者，隨文觀想，字字分明。
四供施六度方便。以藥師經中所載方法，齋戒供養，放生佈施，禮拜歌詠等，此處必當隨順本願，生普賢行願，行五悔法：懺悔，勸請，隨喜，回向，發願。至誠祈願，自得人佛交感，起不思議大用。
五圓通方便。楞嚴二十五圓通，東方不動佛土中，琉璃光法王子所得圓通，蓋秘密涵藥師佛之果德。藥師不動二大師，教內常說是不二，如憑此觀風大，亦得隨順趣入，登無生忍。
六配合止觀。修諸止觀及度行等，先發菩提心，生彼十二願，求佛加持，亦自念當入常寂光土——即琉璃光土是也。誦灌頂咒或七，或百八遍，再起正行。此等止觀，正說圓教止觀，旁說一切禪定般若二波羅密多。
藥師法之意趣，非別立宗門，自成一派，漢藏南北，三系八宗，均可以之為加行。八萬四千法門如帝網，而藥師本願重重影現，正是如來化物，時教之極。滿眾願，起大心，轉聖道，現勝樂。亦如噶瑪巴言：此法雖是事部密，而通無上密也。其相雖淺，其義不深乎？
下能以法水蕩滌有情之穢欲，上能用智舟任運眾生至真覺，藥師法門之宗趣，如來化物之因緣，今明矣。
四、論用：
明宗既已述諸行門，論用當正說化他之旨。菩薩發心，乃至「不修深禪」，亦要游化世間，暫無休息，此之精進，當勤發之。藥師如來所發誓願，初中後善，清淨圓滿，純一梵行，若欲起大用，亦須以此著手。
先說藥師經法三重守護。台密澄圓大師解：
一， 日夜守護。日光月光二菩薩也。
二， 十二時守護（今二十四小時），十二神將也。
三， 唸唸守護。十二神將，各有七千眷屬，合之則為八萬四千，既八萬四千無量念中，悉皆守護。
復依三主要道者，宗大師之論著已深明矣，此不贅述。但以此自修之要，可詮化他方法。今以此為綱，試論之。
出離心者，當念出離五住地及諸相似法愛，日日精勤暫無休息。復次，藥師經中多明富貴長壽諸願求，當知與此不相違悖。唯一當念：世間諸苦，當下即空即假即中，欲覓逼迫相了不可得。如此日夜思維觀照不息，定慧既備，持藥師法者，亦具無量福報，資糧充滿，圓解即開，直臨法王座，遑論上品上生耶。
更論如大乘經典，及教下摩訶止觀，處處教發菩提心，雖因緣不同，然如西方諺云「條條大路通羅馬」，楞嚴有雲「歸元性無二，方便有多門」，既是此義。才發此心，大地震動，大乘精髓，盡在於此。菩提心為何？十二大願也。分分明明，歷歷在目。
不二慧者，上來既述宗趣及諸行門方便，雖言不修深定，然若登地菩薩，剎那百返，豈可不發深心求索？乃至凡夫位中當下一念，勤加觀照，待得功夫純熟，一朝頓開。
如是行持，無往不勝，藥師佛法即成佛之道。信夫！
五、判教：
藥師經法，各各受益不同，論化儀，屬不定，論化法，則四教中，除藏教，通別圓皆有之。且胡諏一句：「胡來胡現，漢來漢現。」「佛以一音而說法，眾生隨類各自解。」大概一來經文，文淺而意深，諸發心學人，審慎觀察，當如藥師經中所言，持戒多聞，正見堅固，方得正明此經義也。
霖然 試造
藥師法門，實是釋迦世尊特勝言教，琉璃淨光，確為三一實相真味表徵。遙念世尊八千往返，塵點劫中悲心降世，現種種身，作種種行，而於無窮暗夜，點無盡之明燈，三身難思，三德超勝。台宗後學慧薄福淺，不諳教觀，欲仿古德五重玄義，略判攝之，多有謬誤，望諸善士不吝斧正。
初、釋名：藥師法門一切功德，皆由本願之所流露。此中意趣，非為匯歸果德尊名之所能表，若論本願，誰不知者？若論功德，或約經之一字者，亦多註疏，此不贅述。但從佛名釋之。
然論名字，則有多解。佛法雖是一相一味，非言思相，然根器不同，施設不同，此中意趣，一雨普潤，草木俱生。法門利益亦復如是，下者得下，中者等中，上者得上，無等者得無等。約通義釋，如太虛，印順，南公，吳老諸所釋者，均通於此。藥者，法藥，師者，九法界之師，琉璃光者，約如如智光。另，藥師表悲，琉璃光表智，福慧不二之菩薩道，即由此顯發。
若論深處，藥，師，琉璃光，亦是同一實相，究竟不二。否則經中所說，唯除等覺，方能明了，豈非謬語？奘本中說：此是如來甚深行處。即在此地。
如來妙方便，均以藥者表徵，經論常言「唯佛一人持淨戒，餘人皆名破戒者」，或言九法界皆病，唯除佛法界，此即以平日所用，四大不調生理病症，代為無明也。而如來興教，被下施言，四種悉檀，無量方便，乃至解脫道，菩提道，密乘道，皆是勝藥。藥師法門，以佛莊嚴而自莊嚴，識病知藥，自服亦教人服，若明此意，當下即是自利利他之菩薩道，更無宗派門戶之見，何故？諸佛教法，一相一味，同運彼岸，不敢輕慢。當今聖教法見相左，斗諍堅固，若能體察此藥師法門之深意，或可拯此於頹勢也。
三身三德尊貴者，亦以師者表之，再論深者，則我等師，如何不是本來覺藏，當下具足，若不外求，即知萬法唯心，無量法藏，一時湧出。何況一色一香，皆是中道，處處是師，處處化佛，華嚴玄門，法華實相，由此而入。
五方佛之不動如來，或如普賢王如來，此不動湛然之法性，即以琉璃光色表徵。如朗朗晴空，淨明通透，如來究竟覺海，即是琉璃光色浩空，風雷雲雨等，猶五住地，此處究竟不可得，而復如幻顯現，與妙圓心者，非即非離。涅槃生死，煩惱覺悟，此等分別戲論，均於琉璃光中，泯絕不現。
若以三諦及三惑配，則師是真諦，斷見思，藥是假諦，斷塵沙，琉璃光是中諦，斷無明。若假湛然大師始終心要言之：明師之真意，則空觀易成，圓斷見思，顯空寂，成般若；明藥之真意，假觀易成，圓斷塵沙，通化導，成解脫；明琉璃光之真意，中觀成就，圓斷無明，法性彰，成法身也。
辨體第二：復明一部之旨歸，眾義之中樞。本經題是本願功德，若言體者，准此可知。當下即是第一佛乘，權實不二。時時勸修，處處令發。
十二大願，「乃至證得無上菩提」，處處明志。第一願者，願無量眾生，得佛身無量莊嚴，安住無量剎土光明，實大千世界，盡化佛國。第二願者，願無量眾生，承辦諸等事業，真事業者，實佛種種化身無量慈濟之事業。第三願者，願無量眾生，得無量受用，真受用者，實報身莊嚴。第四願者，願無量眾生，舍偏邪歸中正，究竟踏履菩提道，法身之妙智也。
上來四願，先明佛土及三身莊嚴。
復約第五願，淨戒得持，行願品中「無垢無破無穿漏」是也。第六願者，諸根具足，身形完好，無有病苦。上來兩者，若約深意，實即佛地之功德，前文已述。
第七願者，身心安樂，眷屬資具具足，此則安住法界虛空，方名無量安樂，眷屬者，理性眷屬，業生眷屬，願生眷屬，神通生眷屬，應生眷屬，皆佛眷屬。
第八願者，轉女成丈夫，問：何故此處，特不以四字，言轉女成男？答：准大般涅槃經中說，女人者，河沙欲樂難滿其欲，然誰是女人？不了身中如來藏，不明當發菩提心者是。非謂具女子根身也。一切惡穢煩惱，頓轉十八不共。如法華經中，龍女即身成佛，即此意也。此藥師經者，能通最上乘者，此處可知。
第九願者，已然明顯。第十願者，煩惱盜賊，無明惡王。第十一願者，無上究竟法味。第十二願者，無量受用。
後合論。然則藥師世尊，既成正覺，我等有情，何不頓具經中所說，依正二報？當知如始終心要言：「真如界內，絕生佛之假名，平等慧中，無自他之形象。但以眾生妄想，不自證得，莫之能返也。」
真言宗光明流悟光上師言：「釋迦佛介紹的譬如說藥師佛是東方琉璃世界，為什麼有這個藥師佛的出現？釋迦佛是讓你的心信仰佛教，你來，把教義給你解釋，向你介紹這種經典、這種作為，那麼藥師佛便進入你心的內體，你自己就變成藥師佛啦！你自己是佛，保庇自己是佛，佛保庇佛！若你是凡夫的心，那麼你就要成為凡夫保庇凡夫。所以唸經、唸咒，有這種信仰——自己是佛，當你唸經唸到一心不亂，很專心，這時你就變成藥師佛！」
藥師經法，既證此境之秘鑰，十二大願皆已成就，切莫再論，何故藥師成佛，我等行人尚有疾病，等觀自心，解悟深意。如開元三大士之不空大師所譯之《成就妙法蓮華經王瑜伽觀智儀軌》言：則悟身中如來藏，無價寶珠今覺知。復次，天台教下，常言：如來之藏，隨緣不變，不變隨緣。隨拈一法，無非法界，心佛眾生，三無差別。復曰：一色一香，無非中道，理具事造，兩重三千，同在一念。
此義甚深難解，不假開示，無由得入。若論訣竅，則當勤觀中道，若尚以為佛與眾生，如天壤雲泥，不解當下即是唯心所造，自然難信難解。
若上所言難解，可依義淨法師之七佛譯本，此中言，若欲成就此種種功德因緣，當勤修藥師經法，當勤念藥師佛名云云。無論解了或是修持，最簡最易。不具別圓菩薩根器者，從此處觀，即可悟入。
三、明宗：藥師經法所實修者，方便有多，究竟匯一，如教下言：圓人用法，無法不圓。諸法門者，亦復如是。縱是如來甚深法，闡提手中難受用。諸成就深淺，均論行人福慧資糧，而均各自輾轉，獲其益也。於末後判教則有言之。此經之所宗者，即是普遍法雨，各得受益，末後匯歸佛道也。
此分釋諸行門，末後匯歸此宗。由是既彰宗趣，亦顯諸行。
一念佛方便。一持名門，此合當世淨宗之持名，乃假佛號，攝於亂心，漸次令心純一，運至伏見思之境，或有更勝。二憶念門，如昏沉暗蔽，觀藥師佛化身相好隨行；如惡念思維，以藥師大日（此處係指報身，即通常所言盧舍那）不二，無量功德莊嚴，悉皆圓滿；如境界逼迫，當思法身之理，或以十二誓願，三主要道為所觀境。此憶念門，即五停心之念佛觀。
二持咒方便。真言教者，三密相應，直趣佛地，而藥師經法，非系密宗之特弘法門，藥師佛者，尚不見於金胎二界，亦乏於弘傳，雖有儀軌普傳，及印明等，未必便如其餘本尊法，為人所重。然諸佛同體，但得至心，無不感應。藥師灌頂咒法，能依師則佳，若苦無阿闍梨，則誦大輪金剛陀羅尼等，亦可跏趺而坐，結印持咒，觀想種字。
三誦經禮懺方便。蓋按儀軌，如弘一律師所集要者，隨文觀想，字字分明。
四供施六度方便。以藥師經中所載方法，齋戒供養，放生佈施，禮拜歌詠等，此處必當隨順本願，生普賢行願，行五悔法：懺悔，勸請，隨喜，回向，發願。至誠祈願，自得人佛交感，起不思議大用。
五圓通方便。楞嚴二十五圓通，東方不動佛土中，琉璃光法王子所得圓通，蓋秘密涵藥師佛之果德。藥師不動二大師，教內常說是不二，如憑此觀風大，亦得隨順趣入，登無生忍。
六配合止觀。修諸止觀及度行等，先發菩提心，生彼十二願，求佛加持，亦自念當入常寂光土——即琉璃光土是也。誦灌頂咒或七，或百八遍，再起正行。此等止觀，正說圓教止觀，旁說一切禪定般若二波羅密多。
藥師法之意趣，非別立宗門，自成一派，漢藏南北，三系八宗，均可以之為加行。八萬四千法門如帝網，而藥師本願重重影現，正是如來化物，時教之極。滿眾願，起大心，轉聖道，現勝樂。亦如噶瑪巴言：此法雖是事部密，而通無上密也。其相雖淺，其義不深乎？
下能以法水蕩滌有情之穢欲，上能用智舟任運眾生至真覺，藥師法門之宗趣，如來化物之因緣，今明矣。
四、論用：
明宗既已述諸行門，論用當正說化他之旨。菩薩發心，乃至「不修深禪」，亦要游化世間，暫無休息，此之精進，當勤發之。藥師如來所發誓願，初中後善，清淨圓滿，純一梵行，若欲起大用，亦須以此著手。
先說藥師經法三重守護。台密澄圓大師解：
一， 日夜守護。日光月光二菩薩也。
二， 十二時守護（今二十四小時），十二神將也。
三， 唸唸守護。十二神將，各有七千眷屬，合之則為八萬四千，既八萬四千無量念中，悉皆守護。
復依三主要道者，宗大師之論著已深明矣，此不贅述。但以此自修之要，可詮化他方法。今以此為綱，試論之。
出離心者，當念出離五住地及諸相似法愛，日日精勤暫無休息。復次，藥師經中多明富貴長壽諸願求，當知與此不相違悖。唯一當念：世間諸苦，當下即空即假即中，欲覓逼迫相了不可得。如此日夜思維觀照不息，定慧既備，持藥師法者，亦具無量福報，資糧充滿，圓解即開，直臨法王座，遑論上品上生耶。
更論如大乘經典，及教下摩訶止觀，處處教發菩提心，雖因緣不同，然如西方諺云「條條大路通羅馬」，楞嚴有雲「歸元性無二，方便有多門」，既是此義。才發此心，大地震動，大乘精髓，盡在於此。菩提心為何？十二大願也。分分明明，歷歷在目。
不二慧者，上來既述宗趣及諸行門方便，雖言不修深定，然若登地菩薩，剎那百返，豈可不發深心求索？乃至凡夫位中當下一念，勤加觀照，待得功夫純熟，一朝頓開。
如是行持，無往不勝，藥師佛法即成佛之道。信夫！
五、判教：
藥師經法，各各受益不同，論化儀，屬不定，論化法，則四教中，除藏教，通別圓皆有之。且胡諏一句：「胡來胡現，漢來漢現。」「佛以一音而說法，眾生隨類各自解。」大概一來經文，文淺而意深，諸發心學人，審慎觀察，當如藥師經中所言，持戒多聞，正見堅固，方得正明此經義也。
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